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为了解滇西北地区水生真菌群落结构、多样性特征和分布格局,本研究从独龙江、怒江、澜沧江、金沙江和苍山黑龙溪,采集沉水枯枝及水样,记录海拔、温度、经纬度、p H、植被等相关信息并通过多因子分析,获得滇西北地区水生真菌群落结构、分布格局与环境因子之间的关系。通过ITS, 18S, 28S, RPB2和TEF1α序列分析,构建了部分物种系统发育树,与现有的分类体系相比,本系统更趋于自然分类系统。本研究在澜沧江、怒江、金沙江、独龙江和苍山黑龙溪采集1495份样品进行检查,共获得1502株菌株,保存干标本1502份,有效序列890条,目前提交60条序列到Genbank。经过形态学和分子系统学鉴定出水生子囊菌及无性型丝孢真菌167属337种,捕食线虫真菌4属,17种。描述了1新科:Distoseptisporaceae;3新属:Neotorula、Distoseptispora.、Pseudosporidesmium.;14新种:Dendryphion aquaticum、D. submersum、Distoseptispora fluminicola、D. aquatica、Kirschsteiniothelia submersa、Neotorula aquatica、Sporidesmium aquaticum、S. submersum、S. fluminicola、Phragmocephala garethjonesii、Minimelanolocus asiaticus、 M.aquaticus、M. melanicus和Lentithecium cangshanense,结合海拔、温度、经纬度、p H、植被等环境因子,通过指数模拟分析、多样性指数及相似性分析,结果表明与多样性相关性最为明显的是海拔和随海拔而变化的温度,在中低海拔水生真菌多样性最为丰富,随海拔升高到一定范围,多样性与海拔呈现负相关;由于采样地p H变化范围小,p H没有成为该地水生真菌分布的限制因子;低纬度地区的水生真菌多样性比高纬度地区高;由于所采集的腐木样品树皮已经脱落,无法鉴定到树种,因此植被和物种多样性之间的关系无法分析。滇西北水生真菌的分布格局:高海拔地区多样性比低海拔低,在不同海拔形成不同的优势类群,西边低纬度河流的多样性比东部高纬度高;不同的河流有各自的特有种分布,世界广布属葚孢属Sporidesmium,在滇西北地区也分布广泛,除此之外,Minimelanolocus, Dactylaria, Ellisembia, Helicomyces,Periconia, Phaeoisaria, Sporidesmiella等在云南滇西北地区分布广泛,出现频率最高的是Minimelanolocus属的物种。独龙江多样性最高,其次是苍山黑龙溪,最低的是澜沧江,其次是金沙江。