光裸方格星虫(Sipunculus nudus)线粒体基因组全序列特征比较及系统进化分析

来源 :年中国水产学会学术年会论文摘要集 | 被引量 : 0次 | 上传用户:RyanD
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本文采用Genome Walking和Long-PCR方法获得中国福建省古雷半岛沿海光裸方格星虫(Sipunculus nudus)线粒体基因组全序列,并比较分析了来自中国古雷半岛和法国孔卡尔诺(Concarneau)地区的光裸方格星虫线粒体基因组的基因组成和结构特点。结果显示,古雷半岛的光裸方格星虫线粒体基因组由38个基因组成,比孔卡尔诺的光裸方格星虫线粒体基因组多一个基因,多出的基因为苏氨酸t RNA,位于16S r RNA和ND3之间,其余37个基因的排序与孔卡尔诺光裸方格星虫一致。古雷半岛光裸方格星虫线粒体基因组A+T含量(58.03%)略高于孔卡尔诺光裸方格星虫线粒体基因组的A+T含量(54.21%);两者22个转运RNA基因长度差异在011 bp之间,其中19个转运RNA的反密码子相同;古雷样品控制区的A+T含量(72.49%)显著高于孔卡尔诺样品A+T含量(66.14%);两个光裸方格星虫线粒体基因组的13个编码基因长度差异在018 bp,编码的氨基酸长度差异在16个氨基酸。基因变异位点分析结果表明,控制区和ND3基因在15个主编码基因中变异位点比例较高,是优先选择作为种群遗传研究的分子标记。系统发育分析结果表明,星虫动物门的古雷半岛光裸方格星虫、孔卡尔诺光裸方格星虫、澳洲管体星虫(Phascolopsis gouldii)和可口革囊星虫(Phascolosoma esculenta)首先聚类,并支持星虫动物门与环节动物的亲缘关系较近的观点。
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