利用支持向量机预测HLA-A*0201结合多肽

来源 :上海市化学化工学会2008年度学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yufengdong
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主要组织相容性复合物(MHC)结合的抗原肽是免疫监督过程中的关键一步。大量的计算机方法应用于这一领域,并且已经取得了不错的预测结果。预测方法有motif法、以结构为基础的方法、机器统计学习的方法等,并达到预报准确率在70%~90%。生物统计主要集中在两个领域:生物序列编码和计算方法。过去研究大都着重在计算方法上,对编码方法的研究相对简单。本文在文献已有的四种编码方法进行计算的基础上,提出了一种新的基于HLA受体蛋白结合环境的编码方法,使模型的预报准确率和稳定性都得到了改进。
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