植物叶绿体基因组中matK基因的分布及引物通用性研究

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matK基因是叶绿体基因组编码蛋白基因中,进化较快的基因之一。2009年被生物条形码联盟(CBOL)推荐为植物DNA条形码研究中的核心序列之一。matK基因的扩增效率一直是matK基因作为通用条形码序列的争议问题之一,然而研究者的着重点一直集中在设计和尝试新的引物,matK基因在植物叶绿体基因组中的系统分布尚缺乏研究。本研究对已发表的75个目,103个科,107个属的272个植物叶绿体基因组序列进行解析研究,发现有近10%的植物叶绿体基因组不包含matK基因。此外,使用KIM3F/KIM1R、390F/1326R和XF/5R引物的联合通用性为97.15%。本研究为DNA条形码研究,特别是matK基因的研究供了重要的参考。
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