【摘 要】
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将来自疑似流行性腹泻病毒感染猪场采集的腹泻粪便样品和小肠组织样品5份,反复冻融三次后,根据GenBank中登录的猪流行性腹泻病毒基因特征设计特异性引物,采用RT-PCR方法
【机 构】
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上海市农业科学院畜牧兽医研究所,上海201106
【出 处】
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上海市畜牧兽医学会2013年学术年会
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将来自疑似流行性腹泻病毒感染猪场采集的腹泻粪便样品和小肠组织样品5份,反复冻融三次后,根据GenBank中登录的猪流行性腹泻病毒基因特征设计特异性引物,采用RT-PCR方法对猪流行性腹泻病毒部分S基因和ORF3基因进行扩增、克隆和测序.并利用DNAStar进行序列对比及进化分析.结果表明：5个PEDV S及ORF3基因核苷酸序列同源性为96.2％～99.6％,氨基酸同源性为86.3％～99.3％.与经典病毒株CV777相比,CH-GZH毒株在PRDV S基因3581-3583bp处存在3个核苷酸缺失；CH-ZJ毒株在ORF3基因245～293bp处缺失49个核苷酸.S及ORF3基因进化树分析结果可知4株PEDV与中国毒株BJ-2011-1亲缘关系近；CH-ZJ独立于其他中国病毒株独自构成一个群体,与其他病毒株有较大差异.
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