在云南南部中华按蚊是重要的传疟媒介,为了了解其各地种群间的遗传变异和种群结构,本研究分析了采自云南南部9个地区5个种群的89头中华按蚊样本的线粒体COⅡ基因.经检测分析发现云南南部中华按蚊的遗传变异较高,平均单倍型多样性指数和核苷酸多样性指数分别是h=0.933,π=0.00406,共发现了51个变异位点占分析位点总数的6.9％;定义了39个单倍型,有2个主要的单倍型H1、H9,分别占单倍型个数的20.2％和12.4％,单倍型网络图显示单倍型分布并没有明显的亲缘地理格局,各个单倍型主要以H1、H9单倍型呈星状分布,系统发育关系没有显示单倍型与地理位置的对应关系;AMOVA结果表明种群内变异大于各种群间变异,不同地区两两种群间的Fst值显示大部分种群间存在基因交流,种群间没有明显的遗传分化;歧点分布图显示为明显单峰分布,中性检测结果均为负值(Tajimas D=-2.25165,P＜0.01;Fu and Lis F* test statistic=-4.89152,P＜0.02)说明,云南南部中华按蚊种群可能经历过复杂的种群扩张事件。