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药用植物有效成分是中药发挥药效的物质基础，随着分子生物学技术和生物工程技术的快速发展，多学科，多领域方法和技术的联合应用加快了活性成分生物合成的研究，为中药资源的深入挖掘和可持续利用提供了新技术和新策略。依托药用植物的生物合成途径解析。通过药用植物代谢工程改良、合成生物学与发酵工程等手段生产有效成分对缓解中药资源的压力具有非常重要的意义。其中，功能基因的筛选、克隆及研究是进行遗传资源挖掘和可持续利用的基础。文章将从药用植物功能基因研究方法、技术以及应用方面总结目前国内外药用植物功能基因研究思路和进展。