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长江三峡工程是举世瞩目的特大型综合水利枢纽工程,是治理和开发长江的关键性骨干工程,它集防洪、发电、航运等效益于一体。但与此同时,三峡工程将改变长江水文情势等导致生态环境改变的诱因,对库区乃至整个长江流域的生态与环境产生广泛而深远的影响,因此生态环境问题一直受到国内外广泛关注。三峡工程生态与环境监测系统是目前国内唯一的跨地区、跨部门、多学科、多层次、综合性的监测研究网络,内容包括水文水质、局地气候、土壤、陆生动植物、水生生物、山地灾害、人群健康、河口生态系统等。本文介绍监测系统的主要任务、内容、组建、总体结构和特色以及三峡工程开工以来所采取的主要环保措施。