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面对新发疾病,中西医理论体系和病名的差异是中医临床借鉴中医古籍筛选治疗方案的严重障碍.以生物学功能为基础的症状是联系西医病与中医证之间的纽带.通过建立以生物学功能为基础的中医古籍疾病知识挖掘方法,从文献记录、现代药理学反推以及建立实验模型三方面综合考虑,可解决当今中医临床面对新发疾病和优势病种采用西医病名而不能利用中医古籍疾病诊疗经验的难题.同时,以生物学功能为基础的中医古籍疾病知识挖掘方法将为新药的开发提供从古籍文献到药理研究的平台.