【摘 要】
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SCoT标记是一种基于翻译起始位点的目的基因分子标记新技术，本研究对SCoT反应体系进行优化,并筛选合适的引物,然后,对24份试材进行SCoT标记,获得的目的片段克隆测序,通过测序
【机 构】
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湖南农业大学园艺园林学院,长沙,410128 国家柑橘改良中心长沙分中心,长沙,410128
【出 处】
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中国园艺学会热带南亚热带果树分会第三届学术研讨会
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SCoT标记是一种基于翻译起始位点的目的基因分子标记新技术，本研究对SCoT反应体系进行优化,并筛选合适的引物,然后,对24份试材进行SCoT标记,获得的目的片段克隆测序,通过测序结果探讨其遗传变异。结果表明：甜橙SCoT标记的20μL优化反应体系为：DNA模板80 ng,Mg2+浓度1.6 mmol/L,dNTPs浓度0.3 mmol/L,引物浓度0.2μmol/L,Taq DNA聚合酶用量1.6 U,扩增产物在100-2000bp之间,扩增条带明亮清晰,反应体系具有良好的稳定性和可重复性。24份试材的测序片段的大小为1090-1091 bp,一致性达到99.84％,存在单碱基的缺失与替换.利用单碱基变异可以区分其中的12个甜橙变异株系和1个杂交亲本。BLAST结果显示,该序列的编码蛋白质与核糖体蛋白S3的N端同源性高。
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