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基因组是一个巨大复杂的软件.细胞的行为是该软件在一定内外环境下运行的结果.定向改变细胞行为的方法之一是基因组的系统生物学改造,而具体的改造策略可以借鉴软件工程的方法.基因组内基因簇之间分成不同的并行和串行模块,这些模块之间的定性定量关系可以改造的空间可能是巨大的.生物能源研究要求我们对某特定物种的特定代谢模块实行明确的控制,不失时机地开展细胞内代谢模块的相对物流量相关的共性关键控制技术对今后的可持续发展是非常必要的.