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子宫内膜异位症虽属于良性疾病，但其浸润及复发等临床表现与恶性肿瘤的生物学行为类似，且有部分子宫内膜异位症会发生癌变，其本身可能有瘤样病变、不典型病变及恶性变三阶段的发展趋势。子宫内膜异位症恶变患者发病较单纯卵巢癌患者年轻，病理类型以卵巢上皮性肿瘤为主，透明细胞癌最为常见，可同时合并有在位子宫内膜肿瘤。肿瘤多为早期，对化疗敏感，5年生存率较无子宫内膜异位症的卵巢癌患者升高，预后较好。临床上一般采用手术+化疗为主要治疗方案，辅以放疗以及激素治疗的综合治疗方法。有回顾性研究显示盐酸伊立替康+顺铂方案在透明细胞癌治疗中有效。