基于转录组的生物絮凝剂合成相关基因的定位与功能解析

来源 :第二十次全国环境微生物学学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:laowang2000
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  生物絮凝剂产生菌Agrobacterium tumefaciens F2在基本培养基(FP24)和絮凝培养基(FX9,EX24),不同时间条件下存在着表型差异,以此为基础分析生物絮凝剂产生菌F2在不同培养条件下多糖合成相关基因的转录水平的差异,以完成A.tumefaciens F2生物絮凝剂合成的关键基因的定位.分别对FP24/FX24、FX9/FX24进行了差异表达基因的分析,发现与FP24相比,FX24样本有1226个转录本表达量呈现上调,926个转录本表达量下调.而与FX9相比,FX24则有1021个转录本表达量呈现上调,364个转录本表达量下调,其中包括多个琥珀酰聚糖合成相关exo基因和多种调控基因.同时,对筛选得到的显著差异基因进行注释和功能解析,初步完构建了生物絮凝剂合成基因簇和合成途径.
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会议
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