【摘 要】
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目的:对成都市2010~2014年肠道病毒71型进行进化与变异分析,探索其基因变异与进化规律,为手足口病的防控提供依据.
方法:选取2010~2014年荧光PCR检测EV71阳性标本,病毒分离后
【机 构】
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成都市疾病预防控制中心;四川大学华西公共卫生学院成都市疾病预防控制中心四川大学华西公共卫生学院
【出 处】
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第六届传染病防控技术研究与应用技术论坛
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目的:对成都市2010~2014年肠道病毒71型进行进化与变异分析,探索其基因变异与进化规律,为手足口病的防控提供依据.
方法:选取2010~2014年荧光PCR检测EV71阳性标本,病毒分离后以一代或二代测序技术进行VP1或全序测定,所得序列构建进化树并进行相关生物信息学分析.
结果:31株病毒VP1基因含175个变异位点,基因同源性为80.36%~100%;氨基酸变异位点12个,同源性99.95%.上述标本基因亚型与阜阳株较为接近,均为C4亚型.2株毒株VP1可能存在基因突变,其中3位点与SNP位点一致.
结论:成都市2010~2014肠道病毒71型基因亚型变异不明显,但需关注VP1变异和SNP位点及其可能带来的防控挑战.
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