珍珠贝转录组及相关功能基因的初步研究

来源 :2012年中国水产学会水产生物技术专业委员会年会暨水产基因与种业学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wolfop
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  珍珠贝可分泌珍珠质,形成高质量的珍珠,具有重大的经济价值.珍珠贝相关基因组数据及资源比较有限,因此在基因组尤其是转录组水平对其遗传和生理进程开展研究极为必要.本实验室构建了四种珍珠贝即马氏珠母贝(Pinctada fucata)、珠母贝(Pinctada margaritifera)、大珠母贝(Pinctada maxima)和企鹅珍珠贝(Pteria penguin)的转录组数据库.四种珍珠贝获得了约25.9~27.0M reads,2.33~2.43G个碱基.序列组装和序列对比后,得到注释的unigenes(≥200 bp)为26,420~33,882条.对其GO,COG和KEGG的聚类分析对比,表明四种珍珠贝的聚类分布基本一致,并且这些数据可以相互验证和补充[1].
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