结合福建省”908专项”,于2006年7～8月对福建省沿岸海域浮游植物群落结构进行了大面积科学调查.结果表明,福建沿岸海域浮游植物隶属于57属127种(含变种、变型、包囊),其中硅藻47属107种,甲藻5属15种(含包囊),蓝藻1属1种,金藻2属2种,隐藻1科1属1种,裸藻1属1种.硅藻类在种类和数量上均占主导地位,优势种以硅藻类为主,柔弱伪菱形藻(Pseudo-nitzschia delicatissima)、中肋骨条藻(Skeletonema costatum),旋链角毛藻(Chaetoceroscurvisetus)、菱形海线(Thalassionema nitzschioides)等.硅藻类在调查海域各个站位均有分布,甲藻类在闽北海域及东山沿岸分布较多,蓝藻类出现频率降低,裸藻类和金藻类出现频率相对增高.表层浮游植物平均密度为3222.59×104个/dm3,数量分布情况为近岸高,远海低,南北高,中部低叶绿素α及优势类群的分布与数量分布基本一致.福建沿岸海域赤潮生物种类较多,是引发赤潮的潜在生物因素,一些赤潮生物已在南部、北部沿岸局部海域成为优势种。