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根据GenBank发表的stx2e序列设计了一对特异性引物，用PCR的方法扩增从临床分离到的猪水肿病大肠杆菌的stx2e基因，将其克隆到pEGM-T载体中，并测定了其序列，推导出Stx2e的氨基酸残基序列。并利用DNASIS序列分析软件对Stx、Stx2、GenBank报道的Stx2e和O138菌株的Stx2e序列进行了比较分析。结果所克隆的O138的Stx2e与GenBank报道的Stx2e在碱基序列上同源性达到99.6％，而在氨基酸水平上其序列完全相同。Stx2e与Stx2的同源性在85％以上。而Stx2e与Stx1的同源性只有42％左右。