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长三角地区已逐步形成经济一体化特征,与此同时,其环境问题也日渐趋同,流域跨界水环境问题更是越来越困扰该地区的协调发展.流域生态补偿机制作为协调上游和下游地区经济发展与环境保护关系的一种环境经济政策,对于长三角地区将起到积极的作用.通过对长三角地区建立生态补偿机制的基础条件和限制因素的分析,提出了基于上下游责任认定的双向补偿模式,并搭建了长三角地区流域生态补偿机制的基本框架.