目的 采用454高通量测序方法对不同饮食结构喂养的不同鼠种肠道菌群进行分析,观察并阐明不同饮食结构下肠道多样性和群落结构的组成差异,进一步比较饮食对肠道菌群的影响在不同鼠种之间是否存在种属差异,为阐明不同人种在同种饮食结构下肥胖、IBD等发病风险存在差异的原因提供线索。方法 选取处于肠道菌群建立阶段、刚断乳的BALB/c小鼠和Sprague Dawley(SD)大鼠作为研究载体,采取为期2个月的5种特制的不同结构饮食干预方法,收集各个饮食组的新鲜粪便样品,提取粪便细菌总基因组DNA,对细菌16SrRNA基因序列V1-V3高变区进行PCR扩增。电泳检测PCR产物并切胶回收纯化。定量检测PCR产物,按照每个样品的测序量要求,进行相应比例的混合。寄往中国上海美吉生物医药科技公司进行454 GS FLX测序。结果 多样性分析结果显示,SD大鼠中,高脂饮食组厚壁菌门相对丰度最高,显著高于高蛋白饮食组和高纤维饮食组；其次为高糖饮食组、普通饮食组。高纤维饮食组的厚壁菌门比例相对最低,显著低于高脂饮食组和高糖饮食组；其他各组间厚壁菌门比例的差异均无统计学意义。拟杆菌门在高纤维饮食组的相对丰度最高,显著高于普通饮食组、高糖饮食组和高脂饮食组；其次为高蛋白饮食组,拟杆菌门的比例显著高于高脂饮食组。高脂饮食组的相对丰度最低,显著低于高纤维饮食组和高蛋白饮食组。高糖饮食组、高脂饮食组和普通饮食组间拟杆菌门比例的差异无统计学意义。结论 高纤维饮食可引起两种鼠种肠道菌群丰度和多样性降低。不同饮食结构的大小鼠均以厚壁菌门和拟杆菌门为主要优势菌,但各个饮食组间厚壁菌门和拟杆菌门的组成比例存在差异,同种饮食结构对两种鼠种肠道菌群的多样性和群落结构的影响存在种属差异。