研发效率反映研发投入与产出间的转换关系,是地区创新能力与增长效率的重要指标。对广泛卷入全球经济联系的发展中地区而言,处于共同的全球价值链但分属不同产业体系的跨国与本土产业间在研发效率上存在显著差异,对地区经济增长效率产生重要影响。本文运用随机前沿分析模型(SFA),以中国高技术产业为例,基于2009—2015年省际面板数据,对跨国与本土产业的研发效率、区域分异及其非效率因素进行实证分析。结果表明:(1)中国本土高技术产业研发的高效率中心主要集中在东部的江苏、山东、浙江及广东,中部地区的研发效率略高于西部。演变趋势表现为东部地区整体呈下降趋势,下降幅度较小;中部地区呈上升趋势;西部地区呈先上升后下降的趋势。(2)跨国高技术产业研发的高效率中心集中在东部的北京、天津、江苏及广东,中部略高于西部,演变态势则表现为东、中部地区整体上升,差距逐步缩小,西部变化不明显。(3)跨国高技术产业研发效率的整体水平低于本土产业,但东部的北京、上海,中部的山西、湖北以及西部的陕西、贵州研发效率高于本土产业。(4)考察期内市场结构、科技扶持、知识产权保护力度、基础设施、劳动力素质等对跨国高技术产业研发效率具有显著地正效应,政府干预的影响不显著;知识产权保护、基础设施、劳动力素质对本土高技术产业研发效率具有显着的正效应,政府干预具有显著的负效应,科技扶持和市场结构的影响不显著。