【摘 要】
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为澄清侵染海南辣椒的马铃薯Y病毒属病毒的株系和亲缘关系,我们克隆了多个辣椒样品上的ChiRSV、PVMV和ChiVMV 3种potyviruses的CP基因,进行了序列多态性分析.以CP基因为
【机 构】
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中国热带农业科学院热带生物技术研究所,农业部热带作物生物技术重点开放实验室,海口 571101
【出 处】
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中国植物保护学会2015年学术年会
论文部分内容阅读
为澄清侵染海南辣椒的马铃薯Y病毒属病毒的株系和亲缘关系,我们克隆了多个辣椒样品上的ChiRSV、PVMV和ChiVMV 3种potyviruses的CP基因,进行了序列多态性分析.以CP基因为基础,结合GenBank中已登录的各病毒CP基因序列,运用最大似然法,构建各病毒的系统进化树.结果表明：ChiVMV各分离物能分成4组,分别命名为Group 1、Group 2、Group 3和Group 4,ChiVMV海南分离物之间的CP基因序列一致性大于98％,是一个株系,且属于其中的ChiVMV Group 1株系；根据系统进化树,ChiRSV海南分离物的CP基因分成两个有差异的簇,各簇内的ChiRSV CP基因序列一致性高,但簇与簇的分离物之间的CP基因序列与CP氨基酸序列一致性分别为91.6％～100％,92.9％ ～ 100％,因此海南辣椒上存在两个ChiRSV株系,暂命为ChiRSV Ⅰ组与ChiRSVⅡ组；PVMV海南分离物CP基因序列一致性大于98％,聚为一簇,属于一个PVMV株系,暂命为PVMV亚洲组.
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