我们采用数值计算的方法来探究两嵌段共聚物薄膜柱状相在正弦波状衬底上三种可能取向的相对稳定性。由于衬底是沿着单一方向波动的，因此柱状相可以与衬底平行或者垂直于衬底，其中平行于衬底的柱状相又可分为柱状相长轴方向沿波纹沟槽或垂直于波纹沟槽两种情况。利用自洽场理论，我们研究了衬底粗糙度和表面偏好对这三种取向之间相变的影响，衬底粗糙度通过改变正弦波状衬底的周期和振幅确定，表面偏好指的是衬底对两嵌段共聚物A 组分有吸附作用。我们发现增加衬底粗糙度会导致平行和垂直柱状相之间或两个平行柱状相之间的相变。在u 较小时，增大衬底粗糙度垂直柱状相较稳定；在u 较大时，垂直柱状相最不稳定，沿着衬底沟槽排列的平行柱状相最稳定。除此之外，改变表面偏好还可以导致柱状相的三个取向之间的相变。随着表面偏好的增强，垂直于波纹沟槽的平行柱状相越稳定。根据六角紧密堆积的柱状相的特性，当衬底波动沿着短的或长的特征长度方向时，衬底对柱状相的作用效果是不同的。我们发现，当衬底沿着长的特征长度方向波动时，垂直柱状相比衬底沿着短特征长度波动时的更稳定。我们的结果与先前的实验很好地吻合，并且更加全面与具体，对实验具有指导意义，有助于嵌段共聚物的柱状相薄膜在纳米技术中的应用。