分税制改革以来，地方保护和市场分割成为我国经济发展中存在的重要问题，带来了一系列的效率损失与社会问题。本文着重探讨了市场分割与环境污染之间的关系，首先通过梳理现有研究资料对市场分割影响环境污染的理论机制进行分析，认为市场分割会通过阻碍技术进步、阻碍产业集聚与结构升级、阻碍能源利用效率提高等路径加剧地区环境污染。在实证层面，利用价格指数法选取28个省份12年七大类商品的价格指数计算市场分割程度，利用熵值法选取5类污染排放物数据计算环境污染指数，使用面板固定效应模型实证检验了市场分割与环境污染之间的关系。结果 发现，市场分割对环境污染具有显著的正向影响，会显著加深地区环境污染程度。考虑到时滞效应，将解释变量进行滞后一期处理，结论依然成立，表明市场分割对环境污染的加剧作用具有持续性。通过建立统一协调的市场，消除地区间的恶性竞争与地方保护，充分发挥市场在要素配置中的积极作用，对于减小环境污染、促进生态文明建设、建设美丽中国具有重要的作用和意义。