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目的:整合性接合元件ICEs兼有质粒和噬菌体的特征,它可通过接合的方式进行转移,其复制方式与温和噬菌体相似,通过整合进宿主染色体,随宿主染色体一起复制。ICEs具有吸收和传播包括毒力因子及耐药基因在内的多种特性基因进入细菌宿主细胞的功能。它们常赋予宿主细菌新的性状,如耐药性和致病性等。SXT/R391元件是革兰氏阴性菌中研究最充分、已知成员最多的整合性接合元件家族,但是其进化特性了解甚少。SXT/R391元件的核心保守区编码的基因介导SXT元件的整合/切除、接合转移和ICEs生命周期所需的调控,本研究的主要目的是探讨SXT/R391核心基因组的适应性进化。方法:收集文献报道的SXT/R391元件,并在测序的细菌基因组序列预测该元件,应用分子生物学软件包RDP4对SXT/R391元件的核心基因序列分别探测重组事件和重组信号,选择在线工具Datamonkey进行SXT/R391元件核心基因的正选择压力分析,了解元件核心基因的进化特性。结果:通过文献搜集和预测,获得了83个SXT/R391元件的基因组序列。包括从文献中提取的54条和数据库中预测的29条,来源包括了21个国家和地区,元件跨越25个菌属,其中在霍乱弧菌中发现的数量最多。经过对83条核心基因的分析,52个核心基因中,有39个依然出现在全部元件中;另外有6个在一个元件中缺少,这些基因可以称为软核心基因;另外有7个基因在两个元件或两个以上元件中缺失。83个元件的整合酶基因有两类,分别称为int-1,int-2,它们的序列相似性为22%。裂解酶xis也有两类分别称为xis-1,xis-2。int-1与xis-1协同出现,int-2和xis-2协同出现。在52个核心基因中,22个发现了重组信号,涉及到元件四个必需模块。7个基因中检测到了正选择信号。结论:同源重组和正选择在SXT/R391元件核心基因的进化过程中发挥了重要的作用。其中,同源重组作为一种进化机制,导致了元件相当一部分核心基因的遗传变异。另外,有7个核心基因显示正选择信号,其中2个与元件的接合转移有关。这些改变都是为了SXT/R391元件适应度的提升,从而能适应生态境的变化。本研究通过SXT/R391元件核心基因的特征及适应性进化分析,为了解SXT/R391元件的扩散及进化规律奠定了基础。