周期性牵张力诱导rBMSCs成骨分化过程中LncRNA-mRNA共表达分析与靶基因的预测

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目的前期研究发现,骨髓间充质干细胞(BMSCs)在机械牵张力作用下成骨向分化是正畸牙移动新骨形成的细胞学基础,但其机制目前尚不明确。有研究表明,长链非编码RNAs(Lnc RNAs)可通过转录及转录后水平调控成骨分化过程。本研究旨在揭示此过程中发挥主要作用的Lnc RNA,阐明正畸牙移动过程中BMSCs的成骨向分化调控机制,以期促进正畸牙移动过程中的骨改建,缩短正畸治疗疗程。材料与方法对周期性牵张力诱导下大鼠骨髓间充质干细胞(r BMSCs)成骨分化过程进行高通量芯片筛选并进行q PCR验证。选择其中表达差异量最大的Lnc RNA通过GO分析以及KEGG通路分析等生物信息学分析方法预测其靶基因。结果芯片结果表明有1518条显著差异表达的Lnc RNAs(其中1162条上调,356条下调,见图1)和3105条显著差异表达的m RNAs(其中1430条上调,1675条下调)(差异倍数FC(abs)≥2,P<0.05)。在同样条件下,选取其中表达差异较大的10条(5条上调,5条下调)进行q PCR验证,结果与芯片结果一致。选择其中表达差异量最大的Lnc RNA XR872929进行深入研究,发现其邻近靶基因Elk-1表达显著上调。结论通过本研究,我们发现Lnc RNA XR872929-上调Elk-1-促进成骨分化的可能调控机制,这为临床上促进正畸牙移动过程中牙槽骨的改建提供重要理论依据和实验基础。
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