来源于我国梨的苹果茎痘病毒分子变异初步研究

来源 :中国植物保护学会2011年学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ely_5
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本研究于2009~2011年从中国云南、浙江、河南、湖北、辽宁和山东等省份采集201份梨样品(主要为砂梨,白梨、西洋梨等其他系统的梨样品占少数),采用RT-PCR技术对其携带ASPV进行检测,54份样品的检测结果为阳性,占26.9%.通过设计特异性引物对ASPV外壳蛋白(CP)和运动蛋白(MP)基因进行扩增、克隆和测序.序列分析的结果显示,所获得的25个分离物(共30个差异克隆)的CP基因全长序列间的相似性为72.2%~99.7%,与GenBank上登录的序列相似性为56.2%~96%.CP基因序列比对发现,来源于同一分离物的分子变种间存在较大的差异,其中,来源于云南的分离物YN-MRS的分子变种间变异最大,达27.6%,而CP基因的变异主要发生在5端,存在严重插入(12~45aa)和缺失(2~20aa).本研究获得25个(共27个克隆)ASPV分离物的MP基因核苷酸序列相似性为75.8%~99.9%,其中,来源于浙江的两个梨分离物ZJ-YG1-1和ZJ-YG1-1相似性最高,达99.9%,而来源于辽宁苹果上的分离物相似性仅79.4%.这些分离物序列与GenBank登录的4个分离物MP基因核苷酸序列相似性为75.3%~92.6%.序列比对发现,MP的分子变异较均匀分布该基因各区域.初步研究表明ASPV的分子变异与寄主存在一定的相关性,但是与地理位置相关性不大.
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