本文在研究我国医院成本核算现有理论基础上,介绍了医院全成本核算流程及具体核算方法，系统阐述了全成本核算在医院管理中提供详细的经济数据，全面反映经营成果。将全成本核算数据应用到绩效考核中，形成一套激励方案。物流系统是成本核算的重要组成部分，一套先进的物流系统能大大降低物质资源成本，提高医院的服务质量。针对医院全成本核算中没有将成本预算与全成本核算结合进行成本控制，没有科学的方法控制公用成本、管理成本等问题，提出建立成本与预算的有效结合，做到事前、事中、事后的控制，采用零基预算控制医院行政管理和公用成本，成本核算只有与奖金分配制度结合才能产生更好的激励作用，完善医院全成本核算体系，将医院经营的重点放到为患者提供优质服务和合理医疗收费上，把患者的需求和利益作为工作地出发点，在一定程度上缓解病人“看病难、看病贵”的难题，使病人获得最大的利益，医院才能创造更多的社会效益和经济效益，逐步符合新医改方案中对医院经营的要求。