【摘 要】
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DNA甲基化是一种重要的表观修饰。它能在不改变基因组DNA初级结构的前提下调节许多关键基因的表达,在生物的生长发育过程中起重要作用。尽管全基因组DNA甲基化模型已经在许多
【机 构】
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南京农业大学大豆研究所国家大豆改良中心农业部大豆生物学与遗传育种重点实验室(综合)作物遗传与种质创新国家重点实验室江苏省现代作物生产协同创新中心;
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DNA甲基化是一种重要的表观修饰。它能在不改变基因组DNA初级结构的前提下调节许多关键基因的表达,在生物的生长发育过程中起重要作用。尽管全基因组DNA甲基化模型已经在许多生物中被报道,但关于大豆质核互作雄性不育的DNA甲基化模型仍然不为所知。我们首次应用甲基化测序技术对大豆质核互作雄性不育系NJCMS5A及其保持系NJCMS5B的花芽组织进行全基因DNA甲基化测序分析。两个材料的比较分析显示有3527个差异甲基化区域(DMRs)和485个差异甲基化基因(DMGs),包括353个高可信度基因、56个编码未知蛋白的基因和76个没有功能注释的未知新型基因。另外,我们随机选取25个DMRs通过重亚硫酸钠盐处理分析验证了全基因组DNA甲基化测序结果的可靠性,9个DMGs通过qRT-PCR分析验证了甲基化水平与基因表达的关系。最终,14个参与花粉和花发育的关键DMGs被鉴定为可能与大豆质核互作雄性不育相关。
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