基于焦磷酸测序技术的肠易激综合征患者肠道菌群16S rDNA多样性研究

来源 :The 14th Congress of Gastroenterology China(第十四届全国消化系病学术会议) | 被引量 : 0次 | 上传用户:satan0wei
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  目的 比较IBS患者和健康对照者肠道菌群结构特征,研究IBS患者肠道微生物群落结构变化情况.方法 纳入符合罗马Ⅲ诊断标准的腹泻型IBS(IBS-D)患者及健康志愿者,所有受试者均无糖尿病、甲状腺疾病等内分泌、代谢性疾病,在入组前1个月未服用过抗菌药物及益生菌,肠镜检查排除肠道器质性疾病.收集粪便标本,提取粪便全基因组,以454焦磷酸测序技术结合生物信息学方法检测粪便肠道菌群16S rDNA V1-V3区多样性,分析解读IBS患者和健康对照者的肠道微生物群落结构.利用基于距离矩阵的进化树、组间差异显著性分析和主成分分析等多种方法对两组样本的肠道菌群结构和物种丰度进行比较.结果 共纳入IBS-D患者25例和健康志愿者11名,IBS-D组平均年龄为(37.770±13.164)岁,健康对照组为(36.083±8.393)岁.基于距离矩阵的进化树聚类结果显示IBS组和健康对照组样本分别聚类,并且组间距离较大,说明两组粪便样本的肠道菌群结构组间相似度低,组间差异大.进一步基于OUT分类单元的PCA主成分分析显示健康对照组粪便样本聚类成一组,IBS组则分布在2个相对集中的区域,聚类成2组.通过组间差异显著性分析发现IBS组样本按不同的主导菌属聚类为2组,第1组IBS样本(64%)肠道菌群Bacteroides拟杆菌属占主导(平均71.4%),与健康对照组(26.1%)相比明显增多(P<0.05);第2组IBS样本(36%)肠道菌群Prevotella普雷沃氏菌属占主导(平均50.7%),比健康对照组(0.07%)也明显增多(P<0.05).结论 IBS患者的肠道微生物群落结构与健康对照者相比发生明显改变,其中拟杆菌属和普雷沃氏菌属含量显著增多.
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