尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)是世界性养殖鱼类,也是研究性别决定与分化的好材料.本研究对尼罗罗非鱼性腺发育的关键时期(孵化后5、30、90 和180 天)进行高通量转录组测序,参考其基因组分析结果表明雌雄性腺总共表达了21334 个基因,其中有21006 个在雌、雄性腺中均有表达,有69 个特异表达于雌性性腺,而259 个特异表达于雄性性腺.四个时期雄性性腺总体表达的基因数目均比雌性性腺多.以不同性别间的表达量倍率≥2 且假阳性错误发生率(FDR)≤0.01 作为筛选标准,最终分别筛选出187、1358 个雌、雄性高表达基因和2978 个雌雄无差异共表达基因.孵化后5、30 天,绝大部分的类固醇合成酶基因(包括cyp19a1a 和cyp19a1b,编码雌激素合成关键酶芳香化酶)在雌性性腺中有较高表达,而在雄性性腺中表达量极低.孵化后90 天,几乎所有的类固醇合成酶基因(包括cyp11b2,编码雄激素合成关键酶11β-羟化酶)在雄性性腺中的表达量均显著上升.孵化后180 天,绝大多数的类固醇合成酶基因在雄性性腺总的表达量进一步升高而在雌性性腺中基本维持不变.该结果反映在性别决定的关键时期(孵化后5 天),雌性性腺中已有雌激素合成,而雄性性腺中缺乏雌、雄激素合成.cyp19a1a 和cyp19a1b 在四个发育时期均表现为雌性高表达的模式,进一步支持了雌激素对于雌性性别决定与性腺维持具有重要作用的结论.孵化后5天,雌性性腺中表达了所有的雌激素受体(esr1、esr2a 和esr2b),并且表达了雄激素受体(ar1 和ar2),而在雄性性腺中只有两个雌激素受体(esr2a 和esr2b)表达,这很好的解释了外源雌、雄激素能够在罗非鱼性腺分化早期诱导其性逆转的原因.本研究为全面了解性别决定调控网络提供海量的数据支持,为阐明罗非鱼乃至真骨鱼类的性别决定及性腺维持的分子机制奠定了基础.