针对泄流结构振动信号低信噪比特性,提出泄流激励下的两阶段模态参数辨识方法。第一阶段滤除振动信号高频和低频噪声：采用小波阈值滤除振动信号中的高频白噪声,抑制EMD端点效应,运用EMD滤除低频水流噪声,还原泄流结构振动有效信息。第二阶段利用基于数据驱动的随机子空间(Stochastic subspace identification,SSI)算法辨识模态参数,采用奇异熵增量理论定阶,结合改进稳定图剔除结构虚假模态。对拉西瓦水弹性试验模型进行模态参数辨识,并与拉西瓦三维有限元模型计算结果进行对比。研究表明：该方法能精确辨识结构模态参数,第一阶段降噪凸显结构真实特性,减少虚假模态,第二阶段采用改进的稳定图再次剔除虚假模态,提高辨识精度,为泄流结构损伤诊断和健康在线监测提供新思路。