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本文利用AFLP技术对栉孔扇贝、华贵栉孔扇贝及其杂交子代的遗传结构进行了分析，实验发现栉孔扇贝♀×华贵栉孔扇贝♂中，父、母本以及子代三个群体间的遗传多样性有59.83％是由群体内个体间的遗传差异造成的，有40.17％来源于群体问遗传结构的差异。子代与栉孔扇贝亲本问的遗传距离为0.1381，而与华贵栉孔扇贝亲本间的遗传距离为0.3432。说明杂交子代群体具有与亲本不同的独立的遗传结构，子代在遗传结构上明显偏向于栉孔扇贝亲本一方，但也具有华贵栉孔扇贝亲本的某些遗传特征。栉孔扇贝群体内遗传相似性指数为O．7037，华贵栉孔扇贝群体为0.7447，子代群体为0.7025。杂交子代的群体内遗传相似性指数小于亲本的群体内遗传相似性指数，说明栉孔扇贝与华贵栉孔扇贝杂交增加了子代的异质性，杂交子代的遗传多样性高于亲代。