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目的:确认miR-375基因表达相关的关键CpG位点,建立甲基化特异性PCR定性与定量分析方法;通过在临床标本中验证其对乳腺癌发生、发展的作用,探索miR-375基因甲基化作为分子标志物应用于临床诊断的可能。
方法:qRT-PCR与亚硫酸氢钠克隆测序方法分别检测四株乳腺癌细胞BT549,MCF-7,MDA-MB-231与T47D中miR-375的表达和其CpG岛中CpG位点的甲基化,筛选miR-375基因表达相关的关键CpG位点:设计靶向miR-375基因关键CpG位点的MSP引物,建立miR-375基因甲基化特异性PCR分析方法,并对乳腺癌及其癌旁组织标本进行定性与定量甲基化特异性PCR检测。
结果:qRT-PCR结果显示,BT549与MDA-MB-231细胞中miR-375的表达明显低于MCF-7与T47D细胞;克隆测序结果显示,miR-375高表达细胞中,其编码基因上游750bp序列中CpG位点几乎均为非甲基化,而miR-375低表达细胞中该区域存在5-40%不同程度的甲基化;靶向该区域的甲基化特异性引物能定性区分非修饰、非甲基化和甲基化模板;定性MSP分析结果显示,乳腺癌组织中miR-375基因的甲基化频率高于其癌旁组织(57.89%vs40%),但无统计学意义;定量MSP分析结果显示,乳腺癌组织中miR-375基因的甲基化程度高于其癌旁组织,具有统计学意义(p<0.01)。
结论:miR-375基因编码序列上游750bp区域为表达相关CpG区域,该区域的CpG位点申基化状态与miR-375基因的表达相关;miR-375基因定量甲基化特异性PCR分析可以辅助区分乳腺恶性病变。