基于疏水性小波分析的膜蛋白结构预测

来源 :第十二届有机分析与生物分析学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:qaz123_family
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膜蛋白在细胞膜上具有重要的生理功能,大部分膜蛋白在药物设计、转运蛋白和免疫识别等方面起着关键的作用,从分子水平上预测这类蛋白质的结构具有非常重要的意义.本文提出一种基于氨基酸疏水性小波变换技术预测膜蛋白跨膜区段数目和位置的新方法.以代码为upkb-bovin的膜蛋白为例,对跨膜螺旋区数目和位置的预测分析进行了描述.从膜蛋白数据库中随机抽取36个蛋白质(含跨膜螺旋区232)作为测试集检测小波分析的预测方法,其中226个跨膜螺旋区能被准确预测,准确率为96.8%.结果表明,这种预测方法具有较高的预测准确性.
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