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高产突变株ZC-7所产中性蛋白酶与其诱变初始菌株枯草芽孢杆菌(Bacillus subtilis)AS1.398所产中性蛋白酶进行比较，研究结果表明，二者最适反应温度和pH相同，分别为55℃和pH7.5，但比活力前者较后者高出了76.24％。PCR扩增两株菌编码的中性蛋白酶基因，通过测序和比对，成熟肽中有五个氨基酸位点发生突变，其中三处发生在已公布的中性蛋白酶催化区域内。在CPHmodels Server网站上进行在线氨基酸序列分析，在预测构建的二级结构模型上可以看到突变位点所处区域的折叠结构发生细微变化。因此推测突变体改变的氨基酸可能处于活性中心，使得酶与底物结合的部位更加适合催化水解反应。