细胞重编程中,外界信号(转录因子等)通过改变组织特异性基因和全能性相关基因区域的表观遗传修饰,对特定基因的表达进行时空精确调控,改变了细胞的命运决定,最终把终末分化的成体细胞诱导为具有自我更新和向多种体细胞发育分化潜能的多能干细胞(iPS细胞)。这一突破性进展为理解胚胎发育的本质提供了很好的体系和思路。我们通过高通量数据和生物信息学比较分析,揭示了在多能干细胞多能性维持中必须对发育相关信号通路。其中,p53信号通路和MAPK信号通路在iPS形成及多能性维持中的作用已经得到充分的研究和证实。染色质表观遗传修饰的变化,是细胞内外多种信号得以整合,并协调发挥作用的最后的末端机制。我们的研究发现,细胞内外信号可以通过形成信号分子/表观遗传修饰酶等复合物特异性调节靶基因区域的表观遗传修饰；microRNA则可以通过调节特定转录因子或表观遗传修饰酶调节基因表达和细胞的功能。结合领域前沿,这些研究的发现有助于我们从另一个侧面理解发育过程和发育相关疾病。