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目的：分析筛选影响疾控机构科研绩效的主要因素，为科研管理部门进一步采取措施提供理论依据。方法：以乌鲁木齐市疾控中心为研究对象，根据中心科教科提供科研档案获得中心全部人员的研究相关资料，并组织中心学委会专家确定科研产出指标并进行权重赋值，共计确定四类12个指标，采用德尔斐法和加权综合法确定科研综合绩效，采用多因素Logistic回归分析科研综合绩效的影响因素。结果：人员年龄、职称级别、国内外学术交流会议情况是影响科研绩效的主要因素。结论：为进一步提高乌鲁木齐市疾控中心科研能力水平，在不断完善科研管理制度的基础上还应进一步加强国内外学术交流与合作的力度。