E.tenella河北株EtMIC-2基因的克隆、序列分析与蛋白结构预测

来源 :第四届京津冀一体化畜牧兽医科技创新研讨会暨“瑞环杯”新思想、新方法、新观点论坛 | 被引量 : 0次 | 上传用户:kongzathu
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利用RT-PCR技术扩增出柔嫩艾美耳球虫(Etenella)河北株EtMIC—2基因,将该基因克隆入pMD—19T载体,进行测序、序列分析与蛋白结构预测.测序显示该基因全长为1029bp,含有一个1029bp开放阅读框(ORF),编码342个氨基酸.该基因与E.tenella杂交株(ZJ)、北京株(BJ)、广东株(GD)、豪顿株(HD)、GenBank上发表的EtMIC-2基因以及布氏艾美耳球虫的MIC—2基因核苷酸序列同源性分别为99.1%、99.7%、99.6%、99.6%、99.8%、40.6%;与其基因编码的氢基酸序列同源性分别为97.7%、99.1%、98.8%、99.1%、99.4%、38.5%.蛋白结构预测显示该蛋白分子量为35KDa,理论等电点PI为4.47,包括4893个原子,分子式C1500 H2429 N431O528S5,丝氨酸(Ser)在20种氨基酸中所占的比例最高,达12.0%,稳定系数为42.19,脂肪系数为77.05;信号肽的位置为前22个氨基酸;空间结构具有17个α螺旋,19个β折叠,15个转角,24处无规则卷曲;只有一个较强疏水位点大约在第8-11氢基酸处,没有跨膜区域.
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