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子宫内膜异位症(endometriosis，EMT)为育龄妇女常见疑难疾病，主要表现为盆腔疼痛、痛经、不孕、月经异常等，虽属良性病变，但具有浸润、转移和复发的恶性生物学行为。蛋白组学是阐明生物体各种生物基因组在细胞中表达的全部蛋白质的表达模式及功能模式的学科。EMT中医辨证缺乏规范化、客观化的辨证标准，临床治疗难、易复发，目前急需进一步揭示EMT发生的分子机制，在早期诊断、治疗方案选择、新型药物筛选和预防复发上取得突破，运用蛋白组学研究EMT有望实现这一突破，本文拟对EMT证候蛋白组学研究的意义和可行性进行初步探讨。