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软骨基质主成分的研究对于骨关节炎的早期诊断以及组织工程等学科的发展具有重要作用.傅里叶变换红外光谱学成像(FTIRI)技术结合化学计量学方法为该类研究提供了强有力的支持[1].而光谱采集过程中不可避免的会引入基线漂移,光源强度的变化,样品的散射效应以及光谱仪自身存在的误差,因此在主成分分析(PCA)前往往需要对光谱进行一定的预处理.本文采用不同方法对来自正常和病变关节软骨样本的红外光谱进行预处理,利用PCA对关节软骨样本进行分类[2].并对分类结果进行比较分析,讨论不同预处理方法对软骨样本的PCA结果的影响.