【摘 要】
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长双歧杆菌是人体肠道核心菌群成员之一，可在人体肠道持续定殖数年，被认为是可反应宿主与微生物共进化路径的典型肠道菌.本研究旨在分析长双歧杆菌菌株水平上的进化历史并
【机 构】
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江南大学食品学院江苏无锡214122
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长双歧杆菌是人体肠道核心菌群成员之一，可在人体肠道持续定殖数年，被认为是可反应宿主与微生物共进化路径的典型肠道菌.本研究旨在分析长双歧杆菌菌株水平上的进化历史并识别其发挥益生功能的关键基因.群体基因组学分析表明，长双歧杆菌可分为4 个亚种，各个亚种分化程度较高(Fst 为0.70).核心基因组上单核苷酸多态性检测结果表明，不同大洲和国家的长双歧杆菌的遗传多样性水平相当，仅日本菌株表现出更高的遗传多样性.泛基因组分析表明，亚洲菌株和中国菌株累积了更高数量的附属基因.另外，同一个宿主中分离的长双歧杆菌也存在基因组多样性，但其归属于同一祖先，表明了单一的定殖事件.长双歧杆菌长亚种为高频重组细菌，其纵向遗传信号被重组掩盖，系统发育树呈辐射状.长双歧杆菌可分成3 个地理相关的种群，种群分化系数低(Fst 为0.05).
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