低温是影响烟草生长发育的主要环境胁迫之一,对烟叶生产有重要影响。为揭示烟草耐冷性的分子机制,我们采用蛋白组学iT RAQ技术对两个耐冷不同的烟草品种NC567和台烟8号进行了研究。共鉴定出4317个差异蛋白,并对四个比较组获得的差异蛋白进行了深入分析。GO分析显示大部分差异蛋白参与代谢和细胞加工过程。在低温条件下,有55个蛋白在NC567中下调表达,但在台烟8号中上调表达。台烟8号中42个蛋白在常温条件下较低水平表达,而低温处理时的表达水平要高于NC567。研究结果揭示了这两个烟草品种在冷胁迫响应上的差异。这些差异表达蛋白涉及蛋白质合成和降解、光合作用和呼吸作用以及活性氧(ROS)清除等,它们对细胞低温响应过程中内在环境的建构具有重要作用。本研究鉴定的低温胁迫相关蛋白和代谢途径对烟草耐低温改良具有指导意义。