阿尔茨海默症(AD)患者往往伴有生理节律的改变，比如睡眠障碍和体温变化异常，这往往是由于时钟基因发生了改变，但是具体机制至今未明。另外，生理节律的紊乱又可加重AD病情，生理节律重置也成为目前治疗AD的一个新方向。为了探究AD病人的节律异常是否由于时钟基因启动子区CpG岛甲基化引起的，我们用甲基化特异性PCR (MSP)方法检测了3x-tg (APP/PS-1/TAU)拟AD小鼠脑区八种主要时钟基因启动子区的甲基化情况。结果检测到CLOCK；BMAL2；CRY1和CRY2四种基因发生了甲基化改变。我们的结果显示，模型小鼠的时钟基因甲基化频率相对于对照小鼠有明显的上升。这说明了，启动子甲基化改变可能是AD导致的时钟基因网络异常的一个重要因素。为AD治疗方向提供了一个新的思路。