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蛋白质和核酸是细胞内最为重要的两类生物分子，蛋白质-蛋白质以及蛋白质-DNA相互作用是介导胞内基因调控等各种复杂活动的主要形式。病原菌的基因调控在其感染与适应宿主环境的过程中发挥着关键作用，因此，系统的分析病原微生物的蛋白质-蛋白质和蛋白质-DNA相互作用网络是理解病原菌致病分子机理的一种有效方法。近年来结核分枝杆菌基因网络与药物靶标研究所取得了进展，基因组尺度蛋白质-蛋白质相互作用网络以及转录调控网络相继被成功构建，多种遗传筛选技术被应用于鉴定结核分枝杆菌生存和感染所必需的基因。这些成果必将为系统的阐明结核分枝杆菌病原性、鉴定新功能基因和发现新药物靶标提供重要线索。