蛋白内部氢键的极化作用稳定小段螺旋体系的必要性

来源 :中国化学会第28届学术年会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lgb0532
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
  蛋白质折叠/解折叠的模拟结果非常依赖于所采用力场的精确性。即使对最简单的蛋白结构,采用现有的力场来模拟,通常不能得出正确的蛋白结构和热力学性质。最近的研究表明缺少极化效应也是不能成功折叠小螺旋的原因之一。在这篇文章中,我们在已有的AMBER力场基础上,对蛋白质主链间的氢键发展了一套简单的,基于公式的原子电荷极化模型,并采用副本交换的分子动力学模拟(REMD)和该极化模型来研究一段小螺旋结构(2I9M)的热力学稳定性。
其他文献
  一对对映体常表现出不同的物理、化学和生理活性,因而纯手性物质需求日益增长[1]。目前公认的经济有效的方法是通过不对称手性催化反应生成高纯度的手性产物[2],虽然如此,催
  三维荧光光谱结合化学计量学方法能大大提高对复杂混合物及多组分体系的分析能力,我们将三维荧光与平行因子算法相结合用于研究反应过程.取1.8mL 4-硝基-1,8-萘酐溶液(5*
  在特定催化剂条件下,主产物的绝对构型研究是不对称催化反应的关键问题之一。本文提出采用与手性中心直接键连的原子的类型,例如芳香原子,生成仲醇化合物的手性指数,并将手性
  多巴胺是脑内重要的神经递质,是一种信号转导分子。多巴胺通过不同的受体调控运动功能、认知活动和药物成瘾等生理、病理过程,与药物滥用成瘾、精神分裂症以及帕金森等病
中色股份从开设以来主要从事有色金属矿山、冶炼的项目建设,多活动于第三世界,因此在第三世界矿业快速发展中具有先天优势。目前公司的蒙古图木尔廷敖包锌矿、老挝铝土矿的控
  本项研究采用比较分子力场分析(CoMFA)和比较分子相似性指数分析(CoMSIA)构建了磺胺类药物与1株单克隆抗体的三维定量构效关系(3D-QSAR)。抗体对17种磺胺类药物的活性由
  稀有事件是指在噪声驱动下、发生概率极低、一旦发生则会给体系带来重大变化的事件。例如成核过程、化学反应、蛋白质折叠、基因开关等。由于这些事件发生的时间尺度比体
  Heat shock protein 90 (Hsp90) takes part in the developments of several cancers.Novobiocin,a typicallyC-terminal inhibitor for Hsp90,is probably used as an
会议
  耗散粒子动力学(DPD)能够在介观尺度有效地模拟软物质和生物体系的自组装,但已有的格点法在处理静电相互作用时包含了带电粒子的自能[1],引起很强的内向压强,不能研究聚电解