齐口裂腹鱼微卫星富集文库的构建与微卫星位点的筛选

来源 :第二届中国西部动物学学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:fengyuguohou2009
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  齐口裂腹鱼(Schizothorax prenanti)属于鲤科、裂腹鱼亚科、裂腹鱼属,俗称“雅鱼”,是一种冷水底栖性鱼类,主要分布在长江上游、金沙江、岷江、大渡河、青衣江等水系.该鱼因肉质细嫩,味道鲜美而深受人们喜爱,是我国特有的重要经济鱼类.近年来,由于过度捕捞、环境污染,特别是随着三峡水库的修建,长江中上游干支流水文条件的改变,野生齐口裂腹鱼的生境遭到了严重的破坏,种群规模逐渐减小.为了防止齐口裂腹鱼野生资源的进一步减少甚至灭绝,有必要加强对其遗传多样性和种群遗传结构的研究.微卫星标记作为一种多态信息含量较高的共显性标记,被广泛应用于遗传学研究中.本研究运用磁珠富集法构建了齐口裂腹鱼(AC)二碱基和(GATA)四碱基重复的微卫星文库,筛选出阳性克隆305个(二碱基阳性克隆145个,四碱基阳性克隆160个),通过测序,得到41个含有AC重复和71个含有GATA重复的微卫星序列.选择设计了76对引物,经过优化,共有30对引物能够产生稳定、清晰地目的产物带(二碱基重复微卫星10个,四碱基重复微卫星20个).已有核型分析实验显示齐口裂腹鱼为六倍体,在本研究中,用这些微卫星引物扫描24个齐口裂腹鱼基因组DNA,分型结果显示,每个个体在每个位点的STR分型图最多达到6个峰,证实了齐口裂腹鱼六倍体的特性.此外,多态性检测表明这些位点的等位基因数变化范围为2-23个,平均等位基因数为11.9个;Neis基因多样性指数变化范围为0.279-0.943,平均为0.789; 多态性信息含量的变化范围是0.278-0.936,平均为0.791.我们的研究首次筛选了齐口裂腹鱼微卫星位点,这些位点可被用于齐口裂腹鱼遗传多样性评估和种群遗传结构的分析.
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