GWAS技术研究综述及其对绵羊多种性能基因挖掘的应用

来源 :第十三届(2016)中国羊业发展大会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:woaiyueyue1314
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本文从全基因组关联研究的概念和特点、常用统计方法及其研究方法对绵羊多种性能基因挖掘的应用进行综述,文章指出。张莉等通过对329只绵羊(主要是尼特羊、德国肉用美利奴羊和杜泊羊)的11个肉用性状的数量性状开展全基因组关联分析,筛选后得到36个SNPs与断奶前日增重、断奶后日增重、断奶重、六月龄重、日增重、胸围和管围这7个相关肉用性状显著相关。通过基因注释,获得25个可能与绵羊肉用性状相关的潜在候选基因,但未获得到与初生重、体高、背膘厚度和眼肌面积显著相关的SNPs位点。Zhipeng Wang等人对中国765例中国美利奴绵羊进行GWAS分析研究,通过全基因组数据与羊毛纤维直径、羊毛变异纤维直径系数、羊毛细度分散、羊毛纤维长度和羊毛卷曲度五个羊毛性状进行关联分析后,发现28个SNP位点与美利奴羊羊毛纤维直径变化的纤维直径系数、细度分散性好、卷曲显著相关,其中43%的显著SNP为己知的相关基因。Sutárez-Vega等通过结合GWAS与RNA测序途径对西班牙绵羊进行全基因检测以及分析后,发现绵羊11号染色体区域与交界性表皮松懈症相关相关,并确定了该区域ITGB4基因为最佳候选基因,证实了该基因的外显子上具有4bp的缺失,而这个缺失会导致基因突变产生整合素4蛋白齣改变,从而进一步影响羊皮肤性状的改变,产生表皮松懈的症状。
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