本文利用基于协整理论的向量误差修正模型(VECM)分析了2000年至2004年我国货币市场利率(银行间拆借和回购市场)、国债市场收益率(银行间市场和交易所市场)、股票市场指数(上证A股市场)之间的长期均衡和短期互动关系。我们发现，货币市场和债券市场的内部都存在着相当稳定的长期均衡和短期互动关系，银行间市场和交易所之间长期分割的现象已经基本得到解决，但是，货币市场与债券市场之间的均衡关系却比较脆弱。股票市场与其他市场不存在长期均衡关系，短期互动效应也比较弱。就市场参与者而言，这意味着当前尚没有充分的套利机制来规避金融市场中的系统性风险；就货币政策而言，这意味着即使在业以市场化的金融市场利率体系中，尚没有稳定、有效的利率传导渠道。因此，本文建议当前应该着力于金融市场建设，尤其是加快以国债期货为主的远期利率市场的发展。