【摘 要】
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针对化合物子结构检索速度问题,对分布式计算和并行计算进行了比较研究,发现在较大的化合物子结构匹配工作量情况下,Aneka分布式计算系统可有效提高子结构匹配速度,却不适合
【机 构】
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中国科学院上海有机化学研究所,上海 200032
【出 处】
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第十届科学数据库与信息技术学术研讨会
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针对化合物子结构检索速度问题,对分布式计算和并行计算进行了比较研究,发现在较大的化合物子结构匹配工作量情况下,Aneka分布式计算系统可有效提高子结构匹配速度,却不适合较小的化学子结构匹配工作量,也不适合实时性要求很高的应用;而openMP并行计算技术在多核计算机上能明显地提高子结构匹配速度,但不能在非共享内存系统(如计算机集群)上使用.在比较研究基础上针对分布式计算和并行计算的缺点和优势,提出了综合分布式计算和并行计算特点的新方法建议,有可能显著提高化合物子结构检索的速度.
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