【摘 要】
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本研究基于8个持家基因建立了179株分离自中国和蒙古国的传统发酵乳制品、泡菜、酸面团和酸粥的植物乳杆菌(L.plantarum)和7株分离于中国、美国和英国的乳制品、泡菜、唾
【机 构】
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内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室,呼和浩特 010018
【出 处】
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2015年第十届乳酸菌与健康国际研讨会
论文部分内容阅读
本研究基于8个持家基因建立了179株分离自中国和蒙古国的传统发酵乳制品、泡菜、酸面团和酸粥的植物乳杆菌(L.plantarum)和7株分离于中国、美国和英国的乳制品、泡菜、唾液和粪便等不同来源的参考菌株的多位点序列分型(MLST)研究方案.研究结果表明,186株L.plantarum 被分为73个序列型(STs),73个STs 被分为10个克隆复合体系和23个独特型.其中发现了156个多态位点,每个持家基因的核苷酸多样性值从0.00401(clpX)到 0.03220(groEL),说明基因序列的多样性相对较高.此外,8个持家基因的dN/dS 在0(recA) 到 0.2690(murC) 之间,均小于1,表明8个持家基因受到的纯化选择.根据最小生成树(the minimal spanning tree)和系统发育树图谱(the Neighbour-Joining tree),分析得到L.plantarum的种群结构和菌株来源有关.持家基因的连锁不平衡性分析、Split-decomposition 分析的网状结构、Structure 和ClonalFrame 分析结果都显示重组发生在了186株L.plantarum 菌株间.总之,我们发现L.plantarum 菌株的基因多样性和种群结构和菌株的分离源有一定的关系.这个新的L.plantarum的MLST 方案为我们了解L.plantarum的基因多样性和种群结构提供了线索,同时为L.plantarum 菌株基因分型和进化研究提供了有用的信息.
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